新研究揭示了心脏病风险的生物驱动因素

在过去的 15 年里，研究人员已经确定了人类基因组中数百个与心脏病发作风险相关的区域。然而，研究人员缺乏有效的方法来探索这些遗传变异如何在分子上与心血管疾病相关，从而限制了开发治疗方法的努力。

为了简化对与冠状动脉疾病(CAD)相关的数百种遗传变异的分析，由布莱根妇女医院的研究人员领导的研究小组与麻省理工学院、哈佛大学和斯坦福大学医学院的博德研究所合作，结合了多种测序和实验技术绘制已知 CAD 变异与其影响的生物途径之间的关系。

在《自然》杂志上发表的一项研究中，研究人员将这项技术应用于血管内皮细胞。研究小组发现，一种罕见血管疾病的关键生物学机制可能会影响 CAD 风险。

“研究基因组的数百个区域(单独或成组)如何影响心脏病发作的风险可能是一个艰苦的过程，”布莱根妇女医院遗传学和心血管医学科的通讯作者 Rajat Gupta 医学博士说。

“我们决定需要有更好的图谱来显示遗传变异如何影响基因表达以及基因如何影响生物功能。如果我们能够将这两种图谱结合起来，我们就可以从变异到生物功能之间建立更大的联系。”

研究人员开发的绘图技术称为变体到基因到程序(V2G2P)方法。

首先，研究人员与斯坦福大学医学院的研究人员合作，将之前通过全基因组关联研究确定的 CAD 基因座与受这些遗传变异影响的基因进行了匹配。然后，他们使用 CRISPRi-Perturb-seq(麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所开发的一项技术)一次“删除”数千个 CAD 相关基因，并检查每次删除如何影响所有基因的表达。该细胞中的其他基因。